集体提成计算方式，工时少的怎么算工资？

工厂属于制造业工厂，转正员工薪资计算方式为同个部门的员工提成平分（因为提成是按每件产品多少钱算的，而每件产品的完成是经过整个部门每个人员生产的，所以提成是按部门平分的）。因为涉及到晚上加班的情况，有些员工就加班时间会请假，月底提成还是全部平分（加班费另算），这样就会造成有些员工上班的时间少，但提成还是跟其他人一样，同部门有些员工会有意见，针对这种提成平分，但上班时间不等的情况有什么办法可以平衡么？