公司假期管理办法规定：员工病假全年累计超过60天以上的，病假期间按本人基本工资计发。员工病假期间扣除个人缴纳的“五险一金”费用后，低于当地最低工资标准的80%的，按当地最低工资标准的80%计发。现实案例：员工A累计病假3月已上，按照文件规定，发放基本工资1200，个人应缴纳五险一金1500，当地最低工资标准1400. 请问，这种情况应该怎样处理？