S公司是国有企业1集团下属的一个分公司，主要从事中央空调和机房空调产品的研发和生产。S公司是由1

集团原来的A子公司与B子公司组建而成，组建时，员工主要来自A公司和B公司，同时，为了发展的需要，公司还从人才市场招聘了一部分员工。

公司运营后，来自A公司的员3-c的工资依然按照A公司原来的薪酬标准发放，来自B公司的员工d的工资也仍然按照B公司原来的薪酬标准发放，而从外部人才市场招聘来的员工e则按市场标准发放工资。S公司的薪酬均以月固定工资的形式发放，实行薪酬保密制度。员工c、d、e担任相同的工作任务，然而员工c的工资远多于d，而d又略多于e。由于s公司生产的产品处于国内领先水平，1集团对其非常重视，在S公司成立之初，S公司总经理（兼任1集团副总裁）就曾向员工许诺，公司赢利后将逐步提高员工的薪酬待遇。因此，S公司员工的积极性高涨，在较短的时间内，完成了多个研发项目，并顺利通过评审。产品投放市场后，S公司逐渐开始赢利，而薪酬制度却仍然没有变动，S公司的总经理只是在年末以非公开的形式发放了年终奖。

此后，公司内部关于薪酬收入的小道消息满天飞，员工c、d、e通过一些非正式的渠道也都彼此知道了各自工资和年终奖的数额。在s公司开始赢利后的第一年，公司员工针对薪酬待遇的抱怨之声四起，积极性开始下降，不时有人跳槽，迟到早退现象也经常发生，生产率随之大幅下跌。与此同时，竞争对手向市场推出了同类型的竞争性产品，极大地威胁到S公司的市场地位。

分析S公司的薪酬制度存在哪些问题？